Als Brackwasser bezeichnet man den Mischbereich zwischen Süßwasser und Salzwasser in den Flussmündungen. Durch den Gezeitendruck wird zweimal täglich Salzwasser vom Meer in den Fluss gedrückt und mischt sich dort bis weit stromaufwärts mit dem auslaufenden Süßwasser. Der untere Flussbereich bekommt dadurch einen höheren Salzgehalt an den sich Tiere und Pflanzen angepasst haben.
Der Salzgehalt kann in der Brackwasserregion von 0,1 bis zu 1,0 % variieren. Für den Menschen, viele Landtiere und -Pflanzen ist dieses Wasser zu salzig um es zu trinken.
Die Brackwasserregion steht als unterster Bereich in den Fischregionen. Ihre Namensgeber sind der kleine Kaulbarsch oder die Flunder.